Khi nền kinh tế ngày càng phát triển, chủ trương xã hội hóa giáo dục cũng được nâng cao. Các trường học tư thục từ đó cũng được nhân rộng, tùy theo từng quy mô của trường, các chi nhánh , chế độ chứng từ sổ sách kế toán của các trường cũng khác nhau. Tuy nhiên, công việc kế toán của trường vẫn theo đúng với quy định của luật doanh nghiệp, và theo quy định của phòng và sở giáo dục quản lý.
Với tư cách pháp nhân là một doanh nghiệp nên việc thực hiện các nghiệp vụ thu chi phải được thực hiện đúng quy định sổ sách kế toán đăng ký với cơ quan quản lý thuế, các khoản thu học phí hằng tháng phải xuất hóa đơn theo đúng quy định, mặc dù theo quy định của luật thuế, các khoản thu trong lĩnh vực giáo dục đào tạo được hưởng chính sách không chịu thuế GTGT, nhưng mỗi học sinh vẫn phải được xuất hóa đơn theo đúng tiêu chuẩn. Ngoài ra, các khoản thu từ các quỹ hỗ trợ của nhà nước vẫn phải đực hạch toán rõ ràng, bút toán phải chính xác. Cuối tháng kế toán cần lập các bảng tài khoản các khoản chi như mua dụng cụ, đồ dùng, chi trả lương giáo viên và cán bộ công nhân viên để cuối tháng tổng hợp trong tờ khai 01/GTG và tờ khai tạm tính thuế TNDN, tờ khai sử dụng hóa đơn BC26/AC và bảng báo cáo thống kê cho chi cục thống kê.
Ngoài ra, hằng ngày kế toán phải ghi chép cẩn thận các phiếu nhập kho, xuất kho vật tư và dụng cụ để tổng hợp thành bảng đề xuất mua ngoài hằng tháng cho hiệu trưởng, đến cuối tháng cần phải kiểm kê kho, lập bảng khấu hao tài sản, từ đó giúp hiệu trưởng và ban quản lý có thể theo dõi và đưa ra những quyết định phát triển tốt nhất cho trường. Đặc biệt, kho vật tư cần ghi rõ nguồn nhập từ mua ngoài và nguồn nhập từ chính sách, giúp ban giám hiệu nắm rõ được vật tư, đồ dùng giãng dạy hiện hữu, tránh tình trạng một loại vật tư bị nhập trùng, vừa được lãnh, vừa mua ngoài là thất thoát chi phí của doanh nghiệp.
Cần hợp tác chặt chẽ với phòng nhân sự, hằng tháng cần lập danh sách giáo viên mới để xin cấp mã số thuế cá nhân, đồng thời lập bảng lương chính xác theo bảng chấm công để hạch toán tài khoản lương, làm căn cứ để quyết toán thuế thu nhập cá nhân.
Cuối năm kế toán cần lập báo cáo tài chính theo quyết định 15/2006-BTC, Quyết toán thuế TNDN, Quyết toán Thuế Thu Nhập Cá nhân, và bảng thuyết minh báo cáo tài chính để nộp cho cơ quan quản lý thuế, Sở giáo dục và chi cục thống kê